Ligos biožymenų tyrimų laboratorijoje vykdomi baltymų tyrimai, rekombinantinių baltymų  biosintezės proceso galutinio produkto išskyrimas ir charakterizavimas. Šioje laboratorijoje taip pat vykdoma lėtinių ligų biožymenų paieška, biožymenų išskyrimo, identifikavimo ir vizualizavimo technologijų kūrimas, naujų in vitro diagnostikos priemonių kūrimas.

Iš aukščiau išvardintų taikomųjų mokslinių tyrimų ir eksperimentinės plėtros sričių gali būti teikiamos užsakomųjų tyrimų paslaugos, baltymų tyrimų (išskyrimo, charakterizavimo) paslaugos, galimos įvairios individualiai suplanuotos paslaugos.   

Laboratorijoje vykdomi dviejų pagrindinių krypčių darbai:

• Baltymų tyrimai;
• Ligų biožymenų tyrimai.

Baltymų tyrimai:

• Analitinių metodų, skirtų baltymų analizei, kūrimas;
• Biosintezės proceso metu pagamintų baltymų išskyrimas ir išgryninimas;
• Biosintezės proceso metu pagamintų baltymų analizė ir charakterizavimas:
  • Laboratorijoje naudojamas platus analitinių metodų spektras, reikalingas baltymų gryninimo bei formulavimo procesams vystyti. Pavyzdžiui, pagrindiniais išvalyto baltymo kokybės kriterijais laikomi elektroforezinis švarumas (gelio SDS-PAGE) bei santykinis švarumas, įvertintas size-exclusion ir kitais aukšto efektyvumo chromatografijos metodais (pavyzdžiui, jonų mainų arba atvirkščių fazių HPLC). Dažniausiai, išgryninto baltymo koncentracija yra matuojama UV spektrofotometru. Visi šia metodai yra prieinami mūsų laboratorijoje.
  • Baltymo biologinis aktyvumas yra tiesiogiai susijęs su jo pirminės sekos ir aukštesnio lygio struktūros ypatumais. Pirminės baltymo sekos analizei yra panaudojamas N-galo amino rūgščių sekvenatorius, kurio pagalba galima nuskaityti ne mažiau 20 amino rūgščių, patvirtinant polipeptidinės sekos atitikimą geno užkoduotai sekai. Kartu su intaktinio baltymo molekulinės masės nustatymu masių spektrometrija, N-galo sekvenavimas padeda vienareikšmiškai identifikuoti pirmines baltymų ir peptidų sekas.
  • Baltymo molekulės susisukimą galima tirti panaudojant FTIR spektroskopijos analizę. Jos pagalba galima iššifruoti pagrindinius polipeptidinės grandinės antrinės struktūros elementus. FTIR analizę galima atlikti ne tik baltymo tirpale, bet ir liofilintoje (išdžiovintoje vakuume) medžiagoje, kas yra aktualu, tyrinėjant struktūrinius baltymo pokyčius liofilintose formuluotėse.
  • Tyrinėjant išvalyto baltymo stabilumą, ypatingai svarbu yra žinoti, kiek sub-matomų dalelių turi baltymo tirpalas skirtas parenteraliniai injekcijai. Sub-matomų dalelių MFI matuoklis leidžia suskaičiuoti submatomas daleles, esančias tiriamame baltymo tirpale. Taip pat, MFI analizė suteikia naudingos informacijos apie kiekvienos identifikuotos dalelės morfologiją (spalva, forma, skaidrumas), kas dažnai leidžia identifikuoti sub-matomas dalelių prigimtį.
• Baltymų gryninimo procesų tyrimai, galutinių produktų saugojimo procesų ir farmacinės formos vystymas (tikslinio baltymo išgavimas iš kultūrinio skysčio arba intarpinių kūnelių, refoldavimas iki natyvios baltymo struktūros, gryninimas įvairias metodais, baltyminio tirpalo koncentravimo ir dializės procesai, galutinio išgryninto produkto formulavimas iki farmacinės formos).

Pagrindinė įranga, naudojama baltymų tyrimams:

• Skysčių chromatografijos sistema su UV ir fluorescencijos detektoriais (Waters);
• Skysčių chromatografijos sistema su masių spektrometrijos detektoriumi Bruker (LC-MS);
• FTIR spektrometras (Bruker);
• Baltymų N-galinės sekos sekvenatorius (Shimadzu);
• Spektrofotometras;
• Sub-matomų dalelių MFI analizatorius (Protein Simple).

Ligos biožymenų tyrimai:

• Lėtinių ligų naujų biožymenų paieška;
• Biožymenų išskyrimo, identifikavimo ir vizualizavimo technologijų kūrimas;
• Naujų in vitro diagnostikos priemonių kūrimas;
• Ligų biožymenų naudojami baltymų tyrimams taikomi metodai ir tyrimų įranga (žr. aukščiau).

Palikite žinutę